Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC07

TMEM165, Transmembrane protein 165, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM165Q9HC07 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM165Q9HC07 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM165Q9HC07 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM165Q9HC07 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM165Q9HC07 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM165Q9HC07 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM165Q9HC07 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM165Q9HC07 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM165Q9HC07 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM165Q9HC07 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms