Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC28A3Q9HAS3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC28A3Q9HAS3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC28A3Q9HAS3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC28A3Q9HAS3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC28A3Q9HAS3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC28A3Q9HAS3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC28A3Q9HAS3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC28A3Q9HAS3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC28A3Q9HAS3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC28A3Q9HAS3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC28A3Q9HAS3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms