Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FKRPQ9H9S5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FKRPQ9H9S5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms