Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNDIG1Q9H7V2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNDIG1Q9H7V2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNDIG1Q9H7V2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1Q9H7V2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms