Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RETREG1Q9H6L5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RETREG1Q9H6L5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RETREG1Q9H6L5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms