Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A9

PCNX3, Pecanex-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX3Q9H6A9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX3Q9H6A9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNX3Q9H6A9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNX3Q9H6A9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms