Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD1Q9H4M9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EHD1Q9H4M9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD1Q9H4M9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD1Q9H4M9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms