Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRN3Q9H3W5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRN3Q9H3W5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms