Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2V7

SPNS1, Protein spinster homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1Q9H2V7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms