Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Z9

RBM38, RNA-binding protein 38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM38Q9H0Z9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM38Q9H0Z9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM38Q9H0Z9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM38Q9H0Z9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms