Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NIF3L1Q9GZT8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NIF3L1Q9GZT8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NIF3L1Q9GZT8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIF3L1Q9GZT8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms