Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC90BQ9GZT6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC90BQ9GZT6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC90BQ9GZT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms