Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGAP39Q9C0H5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGAP39Q9C0H5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGAP39Q9C0H5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGAP39Q9C0H5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGAP39Q9C0H5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGAP39Q9C0H5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGAP39Q9C0H5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGAP39Q9C0H5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP39Q9C0H5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ARHGAP39Q9C0H5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP39Q9C0H5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP39Q9C0H5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms