Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKD2Q9BZL6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKD2Q9BZL6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRKD2Q9BZL6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD2Q9BZL6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD2Q9BZL6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD2Q9BZL6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD2Q9BZL6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD2Q9BZL6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD2Q9BZL6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD2Q9BZL6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD2Q9BZL6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD2Q9BZL6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKD2Q9BZL6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms