Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NUSAP1Q9BXS6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUSAP1Q9BXS6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUSAP1Q9BXS6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUSAP1Q9BXS6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUSAP1Q9BXS6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUSAP1Q9BXS6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUSAP1Q9BXS6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUSAP1Q9BXS6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUSAP1Q9BXS6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUSAP1Q9BXS6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms