Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXI9

C1QTNF6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF6Q9BXI9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF6Q9BXI9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF6Q9BXI9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228 ms