Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDC1Q9BTX1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDC1Q9BTX1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDC1Q9BTX1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms