Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCMBPQ9BTE3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCMBPQ9BTE3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCMBPQ9BTE3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCMBPQ9BTE3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms