Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRADC1Q9BSG0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRADC1Q9BSG0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms