Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED2Q99967 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CITED2Q99967 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms