Protein–RNA interactions for Protein: Q96T58

SPEN, Msx2-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPENQ96T58 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPENQ96T58 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPENQ96T58 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPENQ96T58 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms