Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
NUDCD1Q96RS6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUDCD1Q96RS6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCD1Q96RS6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms