Protein–RNA interactions for Protein: Q96QI5

HS3ST6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST6Q96QI5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS3ST6Q96QI5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS3ST6Q96QI5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS3ST6Q96QI5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS3ST6Q96QI5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS3ST6Q96QI5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS3ST6Q96QI5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HS3ST6Q96QI5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HS3ST6Q96QI5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS3ST6Q96QI5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms