Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3Q96PU9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3Q96PU9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3Q96PU9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms