Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCLT1Q96NL6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SCLT1Q96NL6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCLT1Q96NL6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCLT1Q96NL6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms