Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF396Q96N95 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF396Q96N95 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF396Q96N95 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF396Q96N95 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZNF396Q96N95 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF396Q96N95 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF396Q96N95 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF396Q96N95 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF396Q96N95 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF396Q96N95 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF396Q96N95 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms