Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP57Q96MR6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP57Q96MR6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms