Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCZQ96LD1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCZQ96LD1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCZQ96LD1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCZQ96LD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCZQ96LD1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCZQ96LD1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCZQ96LD1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCZQ96LD1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCZQ96LD1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCZQ96LD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms