Protein–RNA interactions for Protein: Q96K19

RNF170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170Q96K19 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF170Q96K19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF170Q96K19 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF170Q96K19 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF170Q96K19 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF170Q96K19 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF170Q96K19 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF170Q96K19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF170Q96K19 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF170Q96K19 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF170Q96K19 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF170Q96K19 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF170Q96K19 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF170Q96K19 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms