Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEIL1Q96FI4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NEIL1Q96FI4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms