Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLC10A4Q96EP9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC10A4Q96EP9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC10A4Q96EP9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC10A4Q96EP9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms