Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MRRFQ96E11 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRRFQ96E11 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MRRFQ96E11 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MRRFQ96E11 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRRFQ96E11 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRRFQ96E11 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRRFQ96E11 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRRFQ96E11 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRRFQ96E11 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRRFQ96E11 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRRFQ96E11 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms