Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUB2Q96DC9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTUB2Q96DC9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUB2Q96DC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUB2Q96DC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms