Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RMDN1Q96DB5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RMDN1Q96DB5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RMDN1Q96DB5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms