Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW1

AP2M1, AP-2 complex subunit mu, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2M1Q96CW1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP2M1Q96CW1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP2M1Q96CW1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP2M1Q96CW1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP2M1Q96CW1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms