Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ULK4Q96C45 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ULK4Q96C45 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ULK4Q96C45 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms