Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2E3Q969T4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2E3Q969T4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms