Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BHMTQ93088 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BHMTQ93088 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHMTQ93088 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms