Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFRSF25Q93038 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFRSF25Q93038 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNFRSF25Q93038 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNFRSF25Q93038 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms