Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDS1Q92903 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDS1Q92903 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDS1Q92903 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms