Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2H4Q92759 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2H4Q92759 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H4Q92759 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2H4Q92759 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms