Protein–RNA interactions for Protein: Q92615

LARP4B, La-related protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4BQ92615 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP4BQ92615 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP4BQ92615 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP4BQ92615 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP4BQ92615 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP4BQ92615 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP4BQ92615 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP4BQ92615 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP4BQ92615 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP4BQ92615 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP4BQ92615 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP4BQ92615 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP4BQ92615 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms