Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms