Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A6Q92581 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A6Q92581 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms