Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RGP1Q92546 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGP1Q92546 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RGP1Q92546 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms