Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEW8

PARD3B, Partitioning defective 3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD3BQ8TEW8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms