Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF128Q8TEB7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF128Q8TEB7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF128Q8TEB7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF128Q8TEB7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF128Q8TEB7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF128Q8TEB7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF128Q8TEB7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms