Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGR3Q8TD06 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGR3Q8TD06 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGR3Q8TD06 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms