Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIN3Q8TB24 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RIN3Q8TB24 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIN3Q8TB24 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIN3Q8TB24 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms