Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATL2Q8NHH9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ATL2Q8NHH9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms