Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP35Q8NFH5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP35Q8NFH5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms